Když kyselý déšť padá do jezera nebo potoka, snižuje pH rovnováhu daného vodního útvaru . Podle US Environmental Protection Agency , většina potoků a jezer mají přirozenou hladinu pH mezi 6,0 a 8,0 . Vodní plochy s hodnotě pH 5,0 nebo nižší , jsou považovány za velmi kyselé . Tání sněhu a silný déšť s chemickým složením může způsobit krátké kyselé odtok v některých oblastech. Mnoho jezer a potoků v USA jsou citlivé na této epizodické acidifikace, které mohou způsobit " úhynu ryb . "
Vodních živočichů
Když kyselý déšť vstoupí do vody , hliník hladiny se zvyšují v jezeře nebo rybníku a snižuje hladinu pH . Tyto faktory mohou způsobit chronický stres pro ryby , což má za následek nižší tělesné hmotnosti; to může učinit je méně schopný při soutěžení na jídlo. Mladší vodní živočichové mají těžší vyrovnat se s těmito podmínkami než u dospělých . Většina ryb vejce jsou schopni vymyslet s hodnotě pH 5,0 nebo nižší . Podle EPA , může žáby odolat hodnotu pH 4,0 nebo vyšší , zatímco mlži a plži vydrží pouze hodnotu pH 6,0 a více . Vzhledem k tomu,ekosystém je na sobě vzájemně závislé , i kdyžzvíře vyšší o potravinovém řetězci snese nižší úrovně pH , nemusí jeho jídlo. Snížení dodávky potravin snižuje rozmanitost v rámci kyselé ekosystému.
Půda a lesy
Kyselý déšť může způsobit rostliny a stromy v lese rostou pomaleji nebo dokonce zemřít . Stromy jsou oslabeny , pokud jsou chemické látky vstřebává přes listy a kořeny , škody, zranění nebo smrt. Když kyselý déšť nebo sníh, to prosakuje do půdy , ale může být neutralizován . Podle EPA , to se nazývá" vyrovnávací paměti zóna " a neutralizacekyseliny závisí na obsahu v půdě . Prostředí , jako je Catskill horách mají nízké pufrovací půdy , což má za následek více stromů zasažených kyselými dešti . Státy jako Nebraska a Indiana mít silnější vyrovnávací paměti půdy , což má za následek méně kyselých dešťů poškození těchto lesů.