Jak vypočítat katalytické účinnosti

Enzymy jsou základní molekuly - katalyzují reakce , které činí život stane. Přírodní nabízí pozoruhodnou řadu enzymů, které katalyzují širokou škálu reakcí . Při srovnávání těchto enzymů , může být někdy užitečné , aby je zvážit , pokud jde o jejich katalytické účinnosti , také nazývánspecifičnost konstanta , která měří , jak efektivněpřevádí enzym substrát ( na molekulu působí na ) do výrobku . Pro enzymy , které následují , co biochemici volání Michaelis - Mentenové kinetiku , tato konstanta může být snadno vypočtena z experimentálních dat . Návod
Stránka 1

Zapište km a kcat . Tyto konstanty jsou určeny experimentálně , takže byste měli již dříve, než začnete se snaží vypočítat specifičnost konstantní.
2

Připomeňme, žeKm představuje (k - 1 + k2 ) /K1 , kde k1 je rychlostní konstanta pro tvorbu komplexu enzym-substrát komplexu , k- 1 , jerychlostní konstanta pro rozpadu tohoto komplexu , a k2 jerychlostní konstanta pro tvorbu produktu z komplexu enzym-substrát . Další ( a možná více osvětlení ) způsob, jak definovat Km je koncentrace substrátu , když jereakce běží na polovinu maximální rychlosti . Je-lienzym má velkou Km , to trvá hodně substrátu k dosažení maximální rychlosti enzymu , zatímco malý Km znamená, že je zapotřebí pouzetrochu substrátu k nasycení dispozici enzym.
3

Připomeňme, že kcat jerychlostní konstanta pro krok limitující rychlost reakce katalyzované enzymem . Krok omezující rychlost jenejpomalejší krok nebopřekážkou, která určuje, jak rychle se celkováreakce může běžet .
4

Rozdělit kcat KM dostat specifičnost konstantní. Například, pokud kcat je 600 sekund ^ -1 a Km je 10 umol , pakkatalytické účinnosti je 60 mikroM ^ -1 s ^ -1 .
5

Všimněte si, že rychlost difúze sady horní hranice na maximální katalytické účinnosti , obvykle v řádu 10 ^ 8-10 ^ 9 m ^ -1 s ^ -1 . Biochemici se někdy říká, žeenzym , jehož katalytická účinnost k této hranici blíží dosáhla " katalyzátor dokonalosti ".